<Чегдомын.Практическая молекулярная биология


  Главная
  Новости
  Справочник
  Рестриктазы
  Методы
  Растворы
  Расчеты
  Обзоры
  Обучение
  Ссылки
  Скачать сайт
  Написать письмо
  О проекте

   English version
  
  


Справочник:
   Единицы измерения.
   Аминокислоты, белки.
   Нуклеотиды, нуклеиновые кислоты.
   Свойства и состав живых организмов.
   Радиоизотопы и флуорофоры.
   Центрифугирование.
   Гибридизация.
   Рестриктазы.

 наверх


Методы:

   Двугибридная система:
   Экспресс метод выделения pDNA из дрожжей.
   Анализ активации репортерного гена LacZ.
   Трансформация дрожжей плазмидной ДНК.
   Выделение плазмидной ДНК из дрожжей на колонках.
   Трансформация дрожжей кДНК библиотекой.
   Проверка взаимодействия двух белков в двугибридной системе.
   Поиск автоактиваторов в двугибридной системе.
   Растворы, среды, антибиотики, добавки для двугибридной системы.
   ПЦР дрожжевых колоний.

     Работа с бактериями:
   Номенклатура генотипа бактерий.
   Бактериальные штаммы для мол. клонирования.
   Хранение бактериальных штаммов.
   Трансформация бактерий.
   Электропорация.
    Бактериальные штаммы для мол. клонирования (Word 2000).
   Гибридизация бактериальных колоний с радиоактивным зондом.

   Выделение pDNA:
   Выделение pDNA (минипреп).
   Выделение pDNA (максипреп).
   Экспресс метод выделения pDNA.
   Очистка pDNA равновесным центрифугированием в CsCl.

   Получение одноцепочечной DNA:
   Амплификация и хранение хелперных фагов.
   Выделение одноцепочечной ДНК.

    наверх

   Работа с фагом лямбда:
   Выделение ДНК фага лямбда.
   Выделение ДНК фага лямбда для приготовления вектора.
   Выщепление pSK(-) из лямбда ZAP in vivo.

   Электрофорез:

   Агарозный гель-электрофорез.
   Заливка агарозного геля.
   Щелочной агарозный гель.
   Перенос по Southern (щелочной).
   Перенос по Southern (в буфере с высокой ионной силой).
   DNA Маркеры.

   Выделение ДНК из агарозного геля с помощью...
   PEG/TAE.
   glass milk.
   LMP-агарозы.
   диализного мешка.
   DEAE - мембраны.
   центрифугирования.

    наверх

   Клонирование:

   Осаждение DNA (RNA) этанолом.
   Другие методы осаждения DNA(RNA) - PEG, Zn, CTAB.
   Мутагенез с помощью Gene Editor system.
   Лигирование.
   Свойства DNA полимераз.
    Свойства DNA полимераз (Word 2000).

   Несистематизированные методики:
   Спектрофотометрическое измерение концентрации.
   Реакция Random primer.
   Определение процента включения.
   Изготовление G-50 spin-колонок.

   Олигонуклеотиды:
   Олигонуклеотиды.
   Отжиг адаптеров.
   Форез олигонуклеотидов.

    наверх

   PCR:
   Состав PCR реакции.
   Параметры PCR реакции.
   Влияние различных веществ на PCR.
   Борьба с загрязнениями при PCR.
   Приготовление Т вектора.

   Cиквенс:
   Cиквенсовая реакция.
   Приготовление сиквенсового геля и форез.
   Сиквенсовая реакция с использованием CycleReader Kit.
   Приготовление сиквенсового геля и форез. Прибор фирмы BioRad.

     Выделение DNA из эукариот:
   Выделение геномной ДНК из культуры клеток.
   Выделение ДНК из крови.
   Фенольный метод выделения DNA из мух.
   Выделение DNA из мух c DEPC.
   Выделение геномной ДНК из растений.

    наверх

   Работа с RNA:
   Выделение RNA из культур клеток.
   Препарирование мышки.
   Выделение RNA из тканей мыши.
   Выделение RNA из мух (фенольный метод).
   Очистка polyA+ RNA.
   Формальдегидный форез RNA - Northern.
   Выделение RNA из мух центрифугированием через CsCl.
   Выделение RNA из мух (с Протеиназой К).
   Синтез RNA in vitro.

   Библиотеки:
   Приготовление геномной библиотеки.
   Скрининг фаговой библиотеки.
   PCR-гибридизация после первичного скрининга.

    наверх

   Работа с белками:
   PAAG электрофорез белков.
   Окрашивание белковых гелей Coomassie R250.
   Окрашивание белковых гелей Zn/имидазолом.
   Окрашивание белковых гелей серебром.
   Определение концентрации белка на 3ММ.
   Высушивание гелей без гель-драера.
   Bicinchoninic acid protein assay kit.
   Western блоттинг.
   Dot-blot для определения рабочей концентрации антител.
   PAAG электрофорез нативных белков.
   Осаждение белков трихлоруксусной кислотой.
   Высушивание гелей на пяльцах.
   Высушивание гелей на рамке.
   Окрашивание белковых гелей Coomassie R250 с метанолом.

   Экспрессия белков:
   Определение активности полимеразы.
   Очистка Taq полимеразы (клон pTp4).
   Очистка Pfu полимеразы (клон pETpfu в BL21(DE3)pLysS).
   Очистка His6-меченного белка на Ni-NTA колонке (me(y)2).
   Частота встречаемости кодонов в различных организмах.
   Поверка взаимодействия двух белков на глютатион-сефарозе.

   Работа с культурами эукариотических клеток:
   Базовые методы.

    наверх

   Иммуногистохимия и in situ гибридизация:
   Обработка стекол.
   In situ гибридизация на политенных хромосомах.
   Фиксация и заливка в парафин (дрозофила).
   Иммуноокрашивание срезов имаго (дрозофила).
   Иммуноокрашивание политенных хромосом.
   Гибридизация in situ на срезах с mRNA (дрозофила).

   Получение серийных делеций:
   Получение серийных делеций с помощью Exo III/MB nuclease.
   Получение серийных делеций с DNase I.

   Анализ профилей экспрессии:
   Random primer на polyA+ RNA.
   Мечение total RNA с oligo(dT) праймера.
   Обработка фильтров перед первой гибридизацией.

   Работа с D. melanogaster:
   Приготовление корма для мух.
   Разведение в больших количествах.
   Сбор эмбрионов D.melanogaster.
   Выделение ядерного экстракта из мух.

 наверх

  Растворы:

   Обучение:
   Приготовление растворов.
   Способы выражения концентраций растворов.
   Использование комбинированных pH электродов.

   Плотности:
   Плотности жидкостей.
   Плотности растворов солей.
   Плотности растворов кислот, оснований и органических веществ.

   Прописи:
   Соли (первая часть)
   Соли (вторая часть)
   Однокомпонентные растворы.
   Антибиотики (биологические свойства).
   Антибиотики (стоковые растворы).
   Среды и добавки.
   Многокомпонентные растворы.

 наверх

Расчеты:

   Нуклеотидные последовательности:
   Операции с нуклеотидной последовательностью.
   Трансляция нуклеотидной последовательности.
   Поиск редких кодонов в кодирующей последовательности.

   Расчёты:
   Расчёт концентрации нуклеиновых кислот по оптической плотности
   Пересчёт скорости вращения в ускорение.
   Вычисление времени роста бактерий.
   Связь биологического количества dNTP’s с радиоактивностью.

   Конверсия:
   Конверсия: масса - моли (для белков).
   Конверсия: масса - моли (для нукл. кислот).
   Конверсия ДНК/белок.
   Пересчёт молярного количества в молярную концентрацию.
   Конверсия единиц измерения.

 наверх

Обзоры:

   Обзоры биологических web-ресурсов:
   Молекулярно-биологические Web-ресурсы.
   NCBI (National Center for Biotechnology Information).
   BioMail.
   Биологическая секция Соросовского Образовательного Журнала.

   Семинары группы экспрессии генов:
   Инициация транскрипции РНК полимеразой II.
   DPE промотор.
   Методы детекции SNP.
   Структура хроматина и транскрипция.

     Обзор программы Vector NTI Suite:
   Приложения в составе Vector NTI Suite.
   Работа с Gel Display Window.
   Конструирование молекул.
   ПЦР анализ при помощи Vector NTI.
   Дизайн молекул.
   Расширенный дизайн молекул.
   Инструменты Vector NTI и Интернет.

   Обзор программы Visual Cloning 2000:
   Возможности Visual Cloning 2000.
   Первый опыт работы с Visual Cloning.
   Visual Cloning – работаем с Интернет.

   Обзор полезных программ.

   Книги А.А. Любищева:
   Проблемы формы систематики эволюции организмов.

 наверх

Обучение:

   Результативная работа.
   Работа со студентами (аспирантами).
   Лаб-минимум.
   Правила выживания в лаборатории.
   Безопасность в лаборатории.
   Работа с автоматической пипеткой.
   Работа с ферментами.
   Стерильная работа.
   Что значит "освоить методику".
   Что такое хорошо и что такое плохо.

 наверх

Cсылки:

   Биологические журналы:
   Web-страницы основных биологических журналов.
   Импакт факторы журналов, A-B.
   Импакт факторы журналов, С-D.
   Импакт факторы журналов, E-I.
   Импакт факторы журналов, J.
   Импакт факторы журналов, K-O.
   Импакт факторы журналов, P-Z и российские журналы.

   Гранты биологического профиля.

   Русскоязычные институты биологического профиля:
   Российская Академия наук.
   Региональные отделения РАН.
   Не входящие в РАН.
   Национальные Академии наук Беларуси и Украины.

   Компании биологического профиля:
   Российские компании.
   Иностранные компании.

   Полезные web-ресурсы:
    Союз образовательных сайтов.

 наверх

Download:

   Site "Practical Molecular Biology":
      English and Russian version ( Zip file, size - 6Mb).
      English version only ( Zip file, size - 1Mb).

   Impact factors 2002 ( Zip file, size - 90kb).










"Практическая Молекулярная Биология" 2000-2003
http://molbiol.edu.ru


Rambler's Top100 Бесплатные библиотеки сети Каталог медицинских ресурсов

Используются технологии uCoz